Les poissons migrateurs effectuent des migrations entre l’océan et les rivières, où ils remontent pour se reproduire (saumon, alose) ou pour se nourrir (anguille, mulet)
La construction d’une passe à poissons sur le barrage d’Arzal a permis le retour de plusieurs espèces de poissons migrateurs vers la Vilaine, en particulier l’alose et la lamproie.
Dans la passe à poissons, un observatoire situé derrière des vitres permet de filmer et compter les poissons, mais aussi au public de les admirer. L’Institution assure le suivi scientifique de la remontée de ces poissons migrateurs. Elle s’intéresse plus particulièrement à l’anguille, dont les effectifs ont diminué de manière alarmante.
Construit sur l’emplacement de la passe à poissons, une passe spécifique permet la migration des civelles (jeunes anguilles transparentes) qui franchissent le barrage en grimpant une rampe garnie de tapis-brosses.
Une seconde passe à civelles a été construite en 2006 sur le mur guide eau à côté de l’écluse. La migration de ces civelles sur le bassin depuis l’embouchure et les prélèvements de la pêche à civelle qui s’exerce au pied du barrage, sont analysés pour fournir les outils permettant une gestion durable de l’anguille.
| Bilan des passages de grands migrateurs aux passes à poissons du barrage d'Arzal de 1996 à 2010 |  |
